Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Bend3Q6PAL0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Bend3Q6PAL0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Bend3Q6PAL0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Bend3Q6PAL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Bend3Q6PAL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Bend3Q6PAL0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Bend3Q6PAL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Bend3Q6PAL0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bend3Q6PAL0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Bend3Q6PAL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bend3Q6PAL0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Bend3Q6PAL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bend3Q6PAL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Bend3Q6PAL0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms