Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2d40Q6P8N9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp2d40Q6P8N9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp2d40Q6P8N9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms