Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Thsd7bQ6P4U0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Thsd7bQ6P4U0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thsd7bQ6P4U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thsd7bQ6P4U0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Thsd7bQ6P4U0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Thsd7bQ6P4U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Thsd7bQ6P4U0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Thsd7bQ6P4U0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms