Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tvp23aQ6NVH0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tvp23aQ6NVH0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tvp23aQ6NVH0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tvp23aQ6NVH0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tvp23aQ6NVH0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tvp23aQ6NVH0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms