Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
B4galnt3Q6L8S8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
B4galnt3Q6L8S8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4galnt3Q6L8S8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196 ms