Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5416Q6IE28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm5416Q6IE28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm5416Q6IE28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5416Q6IE28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms