Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf8Q6DID3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf8Q6DID3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf8Q6DID3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf8Q6DID3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf8Q6DID3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf8Q6DID3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf8Q6DID3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf8Q6DID3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf8Q6DID3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf8Q6DID3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms