Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Smarca2Q6DIC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Smarca2Q6DIC0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Smarca2Q6DIC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Smarca2Q6DIC0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Smarca2Q6DIC0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Smarca2Q6DIC0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Smarca2Q6DIC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
Smarca2Q6DIC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Smarca2Q6DIC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Smarca2Q6DIC0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC43■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Smarca2Q6DIC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Smarca2Q6DIC0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Smarca2Q6DIC0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Smarca2Q6DIC0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Smarca2Q6DIC0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Smarca2Q6DIC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Smarca2Q6DIC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
Smarca2Q6DIC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Smarca2Q6DIC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Smarca2Q6DIC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms