Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ddx11Q6AXC6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx11Q6AXC6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx11Q6AXC6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddx11Q6AXC6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ddx11Q6AXC6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms