Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctnna3Q65CL1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnna3Q65CL1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna3Q65CL1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnna3Q65CL1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnna3Q65CL1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnna3Q65CL1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms