Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn3Q64691 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn3Q64691 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn3Q64691 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn3Q64691 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn3Q64691 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn3Q64691 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn3Q64691 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms