Protein–RNA interactions for Protein: Q64523

Hist2h2ac, Histone H2A type 2-C, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2acQ64523 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2acQ64523 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hist2h2acQ64523 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2acQ64523 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hist2h2acQ64523 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist2h2acQ64523 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist2h2acQ64523 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist2h2acQ64523 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms