Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt12Q64291 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt12Q64291 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt12Q64291 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms