Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CochQ62507 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CochQ62507 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CochQ62507 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CochQ62507 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CochQ62507 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CochQ62507 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CochQ62507 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CochQ62507 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CochQ62507 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CochQ62507 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CochQ62507 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CochQ62507 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CochQ62507 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CochQ62507 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CochQ62507 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CochQ62507 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CochQ62507 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CochQ62507 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CochQ62507 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CochQ62507 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CochQ62507 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CochQ62507 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CochQ62507 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CochQ62507 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CochQ62507 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CochQ62507 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CochQ62507 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CochQ62507 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CochQ62507 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CochQ62507 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CochQ62507 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CochQ62507 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CochQ62507 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CochQ62507 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CochQ62507 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CochQ62507 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CochQ62507 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CochQ62507 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CochQ62507 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CochQ62507 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CochQ62507 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CochQ62507 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CochQ62507 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CochQ62507 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CochQ62507 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CochQ62507 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CochQ62507 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CochQ62507 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CochQ62507 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CochQ62507 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CochQ62507 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CochQ62507 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CochQ62507 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CochQ62507 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CochQ62507 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CochQ62507 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CochQ62507 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CochQ62507 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CochQ62507 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CochQ62507 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CochQ62507 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CochQ62507 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CochQ62507 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CochQ62507 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CochQ62507 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CochQ62507 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CochQ62507 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CochQ62507 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CochQ62507 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CochQ62507 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CochQ62507 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CochQ62507 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CochQ62507 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CochQ62507 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CochQ62507 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CochQ62507 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CochQ62507 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CochQ62507 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CochQ62507 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CochQ62507 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CochQ62507 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CochQ62507 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CochQ62507 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CochQ62507 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CochQ62507 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CochQ62507 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CochQ62507 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CochQ62507 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CochQ62507 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CochQ62507 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CochQ62507 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CochQ62507 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms