Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Vil1Q62468 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vil1Q62468 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vil1Q62468 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Vil1Q62468 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Vil1Q62468 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vil1Q62468 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vil1Q62468 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms