Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sorbs1Q62417 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs1Q62417 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sorbs1Q62417 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sorbs1Q62417 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs1Q62417 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms