Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Supt6hQ62383 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Supt6hQ62383 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Supt6hQ62383 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Supt6hQ62383 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Supt6hQ62383 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Supt6hQ62383 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Supt6hQ62383 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Supt6hQ62383 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Supt6hQ62383 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms