Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf6Q62311 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf6Q62311 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf6Q62311 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf6Q62311 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms