Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Spa17Q62252 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spa17Q62252 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spa17Q62252 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spa17Q62252 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms