Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprrQ62132 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprrQ62132 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprrQ62132 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprrQ62132 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprrQ62132 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprrQ62132 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms