Protein–RNA interactions for Protein: Q61806

Xlr3c, X-linked lymphocyte-regulated protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3cQ61806 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr3cQ61806 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3cQ61806 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xlr3cQ61806 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xlr3cQ61806 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3cQ61806 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms