Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Msi1Q61474 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msi1Q61474 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msi1Q61474 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msi1Q61474 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msi1Q61474 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msi1Q61474 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msi1Q61474 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msi1Q61474 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi1Q61474 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi1Q61474 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms