Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sim2Q61079 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sim2Q61079 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim2Q61079 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim2Q61079 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sim2Q61079 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim2Q61079 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms