Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d1Q60949 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d1Q60949 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d1Q60949 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tbc1d1Q60949 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tbc1d1Q60949 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d1Q60949 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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