Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
NfkbibQ60778 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
NfkbibQ60778 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28,86■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
NfkbibQ60778 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
NfkbibQ60778 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
NfkbibQ60778 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
NfkbibQ60778 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
NfkbibQ60778 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
NfkbibQ60778 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
NfkbibQ60778 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
NfkbibQ60778 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28,71■■■□□ 2,19
NfkbibQ60778 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
NfkbibQ60778 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
NfkbibQ60778 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28,55■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
NfkbibQ60778 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
NfkbibQ60778 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
NfkbibQ60778 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
NfkbibQ60778 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
NfkbibQ60778 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
NfkbibQ60778 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms