Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn2dQ60773 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkn2dQ60773 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdkn2dQ60773 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms