Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Atf3Q60765 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atf3Q60765 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Atf3Q60765 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atf3Q60765 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atf3Q60765 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atf3Q60765 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Atf3Q60765 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Atf3Q60765 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Atf3Q60765 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Atf3Q60765 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atf3Q60765 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Atf3Q60765 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms