Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk2a1Q60737 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a1Q60737 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk2a1Q60737 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk2a1Q60737 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms