Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd4Q60688 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd4Q60688 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxd4Q60688 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd4Q60688 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms