Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpn1lQ5XFR0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpn1lQ5XFR0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms