Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ankrd40Q5SUE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd40Q5SUE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ankrd40Q5SUE8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ankrd40Q5SUE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms