Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc92bQ5SUE3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc92bQ5SUE3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc92bQ5SUE3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc92bQ5SUE3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc92bQ5SUE3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms