Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefmQ5SSK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TefmQ5SSK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TefmQ5SSK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TefmQ5SSK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms