Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnjlQ5SRT8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnjlQ5SRT8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnjlQ5SRT8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnjlQ5SRT8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnjlQ5SRT8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CcnjlQ5SRT8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CcnjlQ5SRT8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcnjlQ5SRT8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CcnjlQ5SRT8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CcnjlQ5SRT8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms