Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms