Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc1Q5NCF2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc1Q5NCF2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms