Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps41Q5KU39 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps41Q5KU39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps41Q5KU39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps41Q5KU39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms