Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrc3Q5DU56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc3Q5DU56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrc3Q5DU56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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