Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Phactr4Q501J7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr4Q501J7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr4Q501J7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phactr4Q501J7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phactr4Q501J7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms