Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Pds5bQ4VA53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Pds5bQ4VA53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Pds5bQ4VA53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Pds5bQ4VA53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Pds5bQ4VA53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Pds5bQ4VA53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
Pds5bQ4VA53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Pds5bQ4VA53 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Pds5bQ4VA53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Pds5bQ4VA53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Pds5bQ4VA53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Pds5bQ4VA53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Pds5bQ4VA53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Pds5bQ4VA53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Pds5bQ4VA53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Pds5bQ4VA53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
Pds5bQ4VA53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Pds5bQ4VA53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Pds5bQ4VA53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Pds5bQ4VA53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Pds5bQ4VA53 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Pds5bQ4VA53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Pds5bQ4VA53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Pds5bQ4VA53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Pds5bQ4VA53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Pds5bQ4VA53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Pds5bQ4VA53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
Pds5bQ4VA53 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Pds5bQ4VA53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Pds5bQ4VA53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Pds5bQ4VA53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Pds5bQ4VA53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms