Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp235Q499D5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp235Q499D5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp235Q499D5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp235Q499D5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp235Q499D5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp235Q499D5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms