Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga1Q3V3R4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga1Q3V3R4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga1Q3V3R4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itga1Q3V3R4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms