Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810049J17RikQ3V2G9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810049J17RikQ3V2G9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810049J17RikQ3V2G9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810049J17RikQ3V2G9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810049J17RikQ3V2G9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810049J17RikQ3V2G9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810049J17RikQ3V2G9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810049J17RikQ3V2G9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1810049J17RikQ3V2G9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms