Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmprss12Q3V0Q7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmprss12Q3V0Q7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmprss12Q3V0Q7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmprss12Q3V0Q7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss12Q3V0Q7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss12Q3V0Q7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms