Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hipk4Q3V016 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hipk4Q3V016 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hipk4Q3V016 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hipk4Q3V016 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms