Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrc4Q3UP24 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrc4Q3UP24 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc4Q3UP24 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc4Q3UP24 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrc4Q3UP24 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrc4Q3UP24 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc4Q3UP24 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc4Q3UP24 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrc4Q3UP24 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrc4Q3UP24 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms