Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfcp2l1Q3UNW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tfcp2l1Q3UNW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tfcp2l1Q3UNW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tfcp2l1Q3UNW5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tfcp2l1Q3UNW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfcp2l1Q3UNW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tfcp2l1Q3UNW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tfcp2l1Q3UNW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfcp2l1Q3UNW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfcp2l1Q3UNW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms