Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap2Q3UND0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skap2Q3UND0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap2Q3UND0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms