Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r7Q3UM45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r7Q3UM45 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r7Q3UM45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r7Q3UM45 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r7Q3UM45 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp1r7Q3UM45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp1r7Q3UM45 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r7Q3UM45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r7Q3UM45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms