Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Usp19Q3UJD6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Usp19Q3UJD6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp19Q3UJD6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Usp19Q3UJD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp19Q3UJD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp19Q3UJD6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Usp19Q3UJD6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms